Visi JPIT
Mewujudkan masyarakat majemuk yang menghormati nilai-nilai keadilan dan demokrasi serta menjunjung tinggi harkat dan martabat manusia melalui studi-studi yang berkaitan dengan perempuan, agama, dan budaya
Misi JPIT
- Melakukan pengkajian ilmiah dan publikasi sehubungan dengan pokok perempuan, agama, dan budaya di Indonesia Timur.
- Memanfaatkan hasil-hasil penelitian dan publikasi untuk pendidikan dan penyadaran masyarakat.
- Menggagas pokok dan metode penelitian yang tanggap terhadap kebutuhan masyarakat akan keadilan, kemajemukan, demokrasi dan hak asasi manusia.
- Mengembangkan kerjasama antar kelompok masyarakat, lembaga atau individu lintas iman dalam melakukan penelitian, pengembangan, dan penyebaran nilai-nilai demokrasi dan hak-hak asasi manusia.